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基因组所相助研究发明RNA甲基化调控造血干细胞发育新机制

  ibet杨运桂研究组与ibet动物研究所刘峰研究组相助研究 ,首次展现m6A mRNA甲基化修饰在脊椎动物造血干细胞发育中的要害调控作用。该研究效果以“m6A modulates haematopoietic stem and progenitor cell specification”为题 ,于201796日在Nature杂志在线揭晓。 

  该相助研究团队在前期研究中发明了斑马鱼中的m6A甲基转移酶复合体(Ping et al, Cell Research 2014)。在此基础上 ,研究职员通过m6A测序手艺(m6A-MeRIP-Seq)发明 ,缺失m6A甲基转移酶mettl3后 ,m6A在胚胎发育相关mRNA中的富集水平显著下降。同时 ,在斑马鱼的血液-血管系统中 ,可检测到mettl3的特异性表达。由此推测 ,m6A修饰与血液发育历程亲近相关。系统的表型剖析显示 ,在mettl3缺失的胚胎中 ,造血干细胞不可正常爆发 ,血管的内皮特征却显着增强 ,内皮-造血转化历程受到阻断。m6A-MeRIP-SeqRNA-Seq综合剖析发明 ,在mettl3缺失的胚胎中 ,一系列动脉内皮发育相关的基因 ,尤其是notch1am6A修饰水平显著降低 ,而其mRNA水平却显著升高。上述效果证实 ,m6A修饰与EHT历程中内皮和造血基因表达的平衡调控相关。别的 ,YTHDF2-RIP-Seq和单碱基区分率的m6A-miCLIP-Seq综合剖析发明 ,m6A通过YTHDF2介导notch1a mRNA的稳固性 ,以维持EHT历程中内皮细胞和造血细胞基因表达的平衡 ,进而调控造血干细胞的运气决议。上述效果在小鼠中也获得了验证 ,证实m6A对造血干细胞运气决议的调控在脊椎动物中是守旧的。 

  该事情首次展现m6A mRNA甲基化修饰在脊椎动物造血干细胞运气决议中的调控机制 ,富厚了对m6A mRNA甲基化修饰在正常心理状态下的生物学功效的熟悉。上述效果不但首次阐释RNA表观修饰在血液发育中的要害作用 ,还将为体外诱导扩增造血干细胞提供了理论指导。 

  ibet动物研究所刘峰研究员和ibet杨运桂研究员是该相助研究效果配合通讯作者。该研究获得了基金委、科技部和中科院战略先导等基金资助。 

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m6A修饰调控造血干细胞爆发模式图。甲基转移酶Mettl3通过m6A修饰决议notch1amRNA水平 ,进而调控内皮-造血转化历程。

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造血干细胞通过内皮-造血转换方法在自动脉血管底部爆发。研究发明 ,新型的RNA甲基化修饰(红色)通过调控造血发育主要基因Notch mRNA的稳固性 ,从而决议内皮细胞(绿色)转酿成造血干细胞(蓝色)。

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